এক বছরের বিরতির পর, শিমুরা শিনপাচি এদো শহরে ফিরে আসে, কিন্তু সেখানে এসে সে এক অবিশ্বাস্য চমকের মুখোমুখি হয়। তার সঙ্গী, ইয়োরোজুয়া দলের দুই সদস্য—সাকাতা গিন্তোকি ও কাগুরা—একেবারে বদলে গেছে! হতবাক হয়ে ইয়োরোজুয়া সদর দফতর থেকে পালিয়ে এসে শিনপাচি দেখতে পায় যে পুরো এদো শহরের মানুষজন অবিশ্বাস্যভাবে বদলে গেছে—তাদের চেহারা এবং ব্যক্তিত্ব একদমই আলাদা হয়ে গেছে। কিন্তু সবচেয়ে অবাক করা ব্যাপার হলো, তার বোন ওতায়ে এখন শিনসেংগুমি প্রধান এবং তার একসময়কার অদ্ভুত স্টকার, ইসাও কন্দোর সাথে বিবাহিত, এবং তাদের প্রথম সন্তান আসছে! এমন বিভ্রান্তিকর পরিস্থিতিতে, ওতায়ে এবং কন্দোর অনুরোধে শিনপাচি শিনসেংগুমিতে যোগ দেয় এবং দেখতে পায় যে শুধু সাধারণ নাগরিকরাই নয়, শিনসেংগুমির ভেতরেও অদ্ভুত পরিবর্তন ঘটে গেছে। তবে, সে আবিষ্কার করে যে শিনসেংগুমি সহ-প্রধান তোশিরো হিজিকাতা একমাত্র ব্যক্তি যিনি একেবারেই বদলাননি। ফলে, শিনপাচি এবং হিজিকাতা একত্র হয়ে এদো শহরকে আগের অবস্থায় ফিরিয়ে আনার পরিকল্পনা করে। এবারও গিন্তামা’র গল্পে থাকবে আরও বেশি কুৎসিত কৌতুক, তীক্ষ্ণ বিদ্রূপ, এবং নির্লজ্জ রেফারেন্স! নতুন সব মজার কাণ্ড ও অদ্ভুত ঘটনার মধ্য দিয়ে ইয়োরোজুয়া দল আবারও এগিয়ে যাবে তাদের হাস্যকর ও রোমাঞ্চকর অভিযানে, যেখানে মানুষের পাশাপাশি বাস করে বহির্জাগতিক প্রাণীরাও।